12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3622 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3622  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3298  hypothetical protein  93.14 
 
 		 102 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  48.91 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  48.18 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  57 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4228  hypothetical protein  43.56 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4338  hypothetical protein  43.56 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.151127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  46.67 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  36.78 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  44.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  40.48 
 
 		 140 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  40.48 
 
 		 140 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>