39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0183 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  293  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  94.77 
 
 		 153 aa  280  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  57.33 
 
 		 104 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3622  hypothetical protein  48.18 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3298  hypothetical protein  46.72 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4338  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.151127 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4228  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  45.67 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  45.67 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  48.86 
 
 		 120 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  48.86 
 
 		 120 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  47.75 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  44.83 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  46.85 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  46.49 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  46.02 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  51.58 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  50 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  49.43 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  52.38 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  53.33 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  36.44 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  35.66 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  39.78 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  61.36 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  39.78 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  62.79 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  70 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  51.67 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  53.19 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  61.11 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  61.11 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4264  hypothetical protein  36 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  45.12 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  40.91 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  40.91 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>