29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0320 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  203  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  58 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  56.67 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4338  hypothetical protein  53.77 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.151127 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4228  hypothetical protein  53.77 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3298  hypothetical protein  54.84 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  74.47 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  74.47 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3622  hypothetical protein  46.28 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  46.24 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  52.38 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  47.5 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  48.75 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  50 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  50 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  48.39 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  57.41 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  57.41 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  58.7 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  38.57 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  46.03 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  38.27 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  58.14 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  40.96 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  40.45 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  42.19 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  45.24 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  43.21 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>