28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2918 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  100 
 
 		 132 aa  256  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  49.12 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  48.25 
 
 		 207 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  47.41 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  46.55 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  50.94 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  41.01 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  46.74 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  68.89 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  48.15 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  48.53 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  37.93 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  42.47 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  35.2 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  32.14 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  45.61 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  34.78 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  60.53 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  47.27 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  47.27 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  34.58 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  34.58 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  45.28 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  45.28 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  45.83 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  30.47 
 
 		 112 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  37.97 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>