45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3297 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  225  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  65.81 
 
 
115 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  51.76 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  72.92 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  57.75 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  55.74 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  55.74 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  59.32 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  66.67 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  45.1 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  50.67 
 
 
207 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  48 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  47.67 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  47.67 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  32.08 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  49.15 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  32.08 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  49.28 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  49.28 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  60.47 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  50.91 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  50.91 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  41.33 
 
 
95 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  51.67 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  45.74 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  53.33 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  52.94 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  41.86 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  41.98 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  41.98 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  43.62 
 
 
153 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  43.9 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  56.36 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3958  hypothetical protein  48.98 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  47.62 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  52.94 
 
 
77 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  52.94 
 
 
77 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  44.64 
 
 
80 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  38.89 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  38.89 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  47.92 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>