21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3958 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3958  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  153  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  48.68 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  46.94 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  44.59 
 
 		 81 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  43.21 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  53.33 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  53.33 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  51.92 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  48.08 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  41.18 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  43.82 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  39.73 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  55.26 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  47.62 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  42.37 
 
 		 114 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  42.19 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  40.45 
 
 		 196 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  51.56 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>