26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3703 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3703  flagellar protein flhE precursor  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0317567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5620  flagellar protein FlhE precursor  60.17 
 
 
138 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.78281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2332  flagellar protein FlhE  36.67 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.296674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2430  flagellar FlhE family protein  36.67 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1309  flagellar protein FlhE  39.29 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.395952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1754  flagellar FlhE family protein  39.29 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2975  flagellar FlhE family protein  33.33 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1762  flagellar FlhE family protein  39.29 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.694188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1549  flagellar FlhE family protein  35.4 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01838  hypothetical protein  39.29 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2171  flagellar protein FlhE  39.29 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2110  flagellar protein FlhE  39.29 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1973  flagellar protein FlhE  39.29 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01849  hypothetical protein  39.29 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2072  flagellar protein FlhE  38.94 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000444905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2127  flagellar protein FlhE  38.94 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000552447 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2067  flagellar protein FlhE  38.94 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0204062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1333  flagellar protein FlhE  38.94 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000226708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1210  flagellar protein FlhE  38.94 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2445  flagellar FlhE family protein  35.4 
 
 
130 aa  67  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1521  flagellar FlhE family protein  40.91 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1864  flagellar FlhE family protein  31.9 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2615  flagellar protein FlhE  42.31 
 
 
78 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000952859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2602  flagellar FlhE family protein  31.03 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.265111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27880  flagellar protein  31.36 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2012  hypothetical protein  34.52 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>