18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3636 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3636  ferredoxin  100 
 
 		 100 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3759  ferredoxin  80 
 
 		 118 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4349  ferredoxin  77.55 
 
 		 111 aa  175  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1824  putative ferredoxin  72.45 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.213573  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  31.18 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  34.74 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  29.79 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  28.42 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  41.51 
 
 		 547 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  40 
 
 		 618 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  33.9 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  37.74 
 
 		 592 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  34.85 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  34.85 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  34.85 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  44 
 
 		 612 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.76 
 
 		 328 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 		 586 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>