112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3647 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3647  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  140  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5579  hypothetical protein  85.07 
 
 		 68 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455819  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4204  protein of unknown function DUF1458  65.67 
 
 		 82 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4314  protein of unknown function DUF1458  65.67 
 
 		 82 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.302415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  69.12 
 
 		 70 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  64.18 
 
 		 70 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  63.24 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11529  hypothetical protein  60.29 
 
 		 70 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0155  hypothetical protein  67.69 
 
 		 71 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.275078  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  60.29 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0100  hypothetical protein  66.15 
 
 		 71 aa  96.7  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  62.12 
 
 		 71 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0268  hypothetical protein  58.21 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0037  hypothetical protein  66.15 
 
 		 71 aa  94  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2504  protein of unknown function DUF1458  57.35 
 
 		 83 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  55.88 
 
 		 73 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0086  hypothetical protein  63.08 
 
 		 71 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0101  hypothetical protein  63.08 
 
 		 71 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  57.35 
 
 		 68 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0101  hypothetical protein  63.08 
 
 		 71 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000474292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0104  hypothetical protein  63.08 
 
 		 71 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  58.21 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3026  protein of unknown function DUF1458  61.76 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0262302 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  63.24 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0923  hypothetical protein  60.94 
 
 		 71 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3195  hypothetical protein  57.58 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  56.72 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00470  hypothetical protein  60.29 
 
 		 71 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.654472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  61.19 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0040  hypothetical protein  60.29 
 
 		 71 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.224078  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  54.41 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1954  hypothetical protein  54.41 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  51.47 
 
 		 70 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  59.7 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  53.73 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1978  hypothetical protein  54.41 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0375499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  51.47 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2980  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  57.35 
 
 		 68 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1015  hypothetical protein  60.29 
 
 		 71 aa  87.8  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.687737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  53.85 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2075  hypothetical protein  52.24 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3527  hypothetical protein  56.06 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_003296  RS05065  hypothetical protein  64.71 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0829  hypothetical protein  51.52 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2873  hypothetical protein  60 
 
 		 71 aa  86.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.272861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  52.24 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0234  hypothetical protein  56.72 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.970646  normal  0.774403 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  52.24 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  52.24 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  52.24 
 
 		 71 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  58.46 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  53.85 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2317  protein of unknown function DUF1458  51.47 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02080  hypothetical protein  56.92 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  53.85 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  56.92 
 
 		 70 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 		 69 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2992  hypothetical protein  54.55 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1942  hypothetical protein  51.47 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00110853  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  52.94 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3623  protein of unknown function DUF1458  48.53 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675874  normal  0.0186505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0772  protein of unknown function DUF1458  55.88 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1147  hypothetical protein  47.76 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0963984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2626  hypothetical protein  57.58 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.679626  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4069  hypothetical protein  48.53 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  49.28 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2011  hypothetical protein  59.38 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0188  hypothetical protein  60 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  52.38 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  46.27 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  43.28 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  48.48 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0927  hypothetical protein  44.78 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0033  protein of unknown function DUF1458  58.82 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3395  protein of unknown function DUF1458  46.15 
 
 		 71 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.42441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  47.62 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0896  hypothetical protein  43.28 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0051  protein of unknown function DUF1458  52.94 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  46.03 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  46.03 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  46.03 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0177  hypothetical protein  44.78 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0882703  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3012  hypothetical protein  46.15 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0195  hypothetical protein  46.27 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4753  hypothetical protein  60.47 
 
 		 46 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.720528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0718  hypothetical protein  44.12 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  39.68 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3147  hypothetical protein  47.76 
 
 		 73 aa  50.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4719  hypothetical protein  75 
 
 		 38 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1790  hypothetical protein  37.88 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416333  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1493  hypothetical protein  37.29 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  29.85 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.373756 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>