More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1893 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 887 aa  1736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  30.23 
 
 		 904 aa  354  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  29.58 
 
 		 904 aa  347  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  33.45 
 
 		 962 aa  343  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  32.24 
 
 		 943 aa  342  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  30.08 
 
 		 903 aa  335  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.06 
 
 		 904 aa  322  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.72 
 
 		 906 aa  298  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.78 
 
 		 882 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  27.28 
 
 		 831 aa  195  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  26.26 
 
 		 833 aa  195  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  24.87 
 
 		 828 aa  194  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  24.01 
 
 		 1043 aa  181  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  26.2 
 
 		 834 aa  178  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  33.2 
 
 		 867 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  25.24 
 
 		 1017 aa  164  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.33 
 
 		 861 aa  157  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.22 
 
 		 901 aa  150  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.53 
 
 		 869 aa  149  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.79 
 
 		 867 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.24 
 
 		 901 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  25.55 
 
 		 632 aa  85.9  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  29.46 
 
 		 641 aa  77.8  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.47 
 
 		 590 aa  75.1  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  23.17 
 
 		 600 aa  75.1  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  21.36 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.22 
 
 		 622 aa  74.7  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  21.36 
 
 		 566 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  28.87 
 
 		 715 aa  73.6  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  30.04 
 
 		 687 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  23.69 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  26.11 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  18.98 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 607 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.36 
 
 		 596 aa  69.7  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  30.17 
 
 		 595 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  22.47 
 
 		 651 aa  70.1  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  25.74 
 
 		 639 aa  70.1  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  29.19 
 
 		 648 aa  69.7  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  24.61 
 
 		 715 aa  68.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  31.65 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  24.69 
 
 		 640 aa  68.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  29.61 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.61 
 
 		 715 aa  68.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  24.48 
 
 		 658 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  31.11 
 
 		 588 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  23.01 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  24.88 
 
 		 658 aa  68.2  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  26.3 
 
 		 637 aa  68.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  25.84 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.99 
 
 		 606 aa  67.8  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 		 906 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0679  Type I secretion system ATPase, PrtD  26.64 
 
 		 572 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 		 906 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  32.06 
 
 		 582 aa  67  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  29.5 
 
 		 595 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  24.04 
 
 		 642 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  32.06 
 
 		 582 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  21.73 
 
 		 597 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  35.71 
 
 		 1231 aa  66.6  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  28.73 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1106  ABC transporter related protein  25 
 
 		 573 aa  66.6  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  23.48 
 
 		 612 aa  67  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  27.56 
 
 		 591 aa  66.6  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  28.64 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  21.73 
 
 		 597 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  22.52 
 
 		 637 aa  66.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  24.5 
 
 		 678 aa  65.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  26.67 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  26.13 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  28 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  28.17 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 		 707 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  25.63 
 
 		 638 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1095  ABC transporter related protein  22.37 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850281  normal  0.198173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  30.2 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  24.53 
 
 		 577 aa  65.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  25.68 
 
 		 652 aa  65.1  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.55 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  24.55 
 
 		 610 aa  65.1  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  23.87 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.51 
 
 		 608 aa  65.1  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.58 
 
 		 616 aa  65.1  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  25.78 
 
 		 724 aa  65.1  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0757  ABC transporter related  23.08 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  21.98 
 
 		 930 aa  64.7  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  25.74 
 
 		 654 aa  64.7  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  36.21 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  24.28 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  29.05 
 
 		 643 aa  64.3  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 		 707 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  22.71 
 
 		 589 aa  63.9  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  22.22 
 
 		 638 aa  64.3  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  27.43 
 
 		 587 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  25.13 
 
 		 975 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 		 707 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  25.39 
 
 		 724 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 		 707 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 		 707 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 		 707 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>