43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2823 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  100 
 
 		 349 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  50.73 
 
 		 349 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  40.74 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  29.91 
 
 		 328 aa  96.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  28.9 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  24.53 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  25.94 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  28.47 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  25.6 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  23.51 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  24.91 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  24.21 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  26.48 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  25.99 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  26.18 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  29.07 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  22.69 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  24.01 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  26.94 
 
 		 270 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  29.22 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  23.06 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  25.96 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  28.43 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  23.2 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  23.34 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  21.69 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  38.89 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.04 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  21.85 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  23.08 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  23.36 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  21.85 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  26.39 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  21.69 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  22.74 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  26.61 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  25.41 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  22.96 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  29.95 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  36.92 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  24.23 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  22.25 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0961  hypothetical protein  36.14 
 
 		 550 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.209127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>