More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0992 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 336 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  49.22 
 
 		 332 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  43.83 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  43.83 
 
 		 359 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2086  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701877 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4672  GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1750  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271582  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4554  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 219 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 222 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  27.8 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2850  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 520 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 252 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  53.9  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 229 aa  53.5  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 229 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 260 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  25.67 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 226 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 229 aa  52.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 238 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6879  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0423677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0364  GntR domain-containing protein  23.38 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  39.68 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  24.6 
 
 		 218 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 213 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  34.52 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  30.61 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 217 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 238 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 220 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 219 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4901  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 267 aa  50.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296075  normal  0.244529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 227 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 232 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  24.6 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  44.62 
 
 		 230 aa  49.7  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 246 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 220 aa  49.7  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 217 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 234 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  26.85 
 
 		 275 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  24.6 
 
 		 218 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  24.6 
 
 		 218 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 239 aa  49.3  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 222 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 232 aa  49.3  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 259 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 266 aa  49.3  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>