More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5476 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 145 aa  288  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  65.75 
 
 		 146 aa  197  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  48.57 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  36.36 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  35 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  40.19 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  35.94 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.71 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  36.19 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  36 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  36.91 
 
 		 623 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  37.04 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 		 606 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 		 618 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  43.14 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 609 aa  73.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  46.84 
 
 		 704 aa  72.8  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  38.71 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  43.48 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  43.69 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  38.64 
 
 		 606 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  38.64 
 
 		 606 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.98 
 
 		 613 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  36.11 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  33.09 
 
 		 666 aa  70.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  35.45 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  39.13 
 
 		 615 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  29.71 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.3 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  32.52 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  34.23 
 
 		 624 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  33.86 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  41.07 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.3 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  37.25 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  31.86 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  36.45 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.82 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.09 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  33.62 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  40.18 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  35.45 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  32.5 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.45 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  34.71 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  37.39 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  35.51 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  37.04 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  28.18 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  33.33 
 
 		 614 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  31.97 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  28.57 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  34.23 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  37.96 
 
 		 615 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 286 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  34.58 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 		 606 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  36.11 
 
 		 615 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  32.71 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  36.19 
 
 		 443 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  42.16 
 
 		 615 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 639 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  38.68 
 
 		 643 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  35.04 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.11 
 
 		 615 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  36.11 
 
 		 615 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  30.23 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  29.46 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.91 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  37.39 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  31.78 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  35.45 
 
 		 645 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1563  hypothetical protein  35.78 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 625 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  32.2 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  31.78 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  40 
 
 		 601 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  41.58 
 
 		 618 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  28.35 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>