More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3992 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  71.63 
 
 		 217 aa  294  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  74.52 
 
 		 219 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 214 aa  241  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  61.76 
 
 		 215 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  61.76 
 
 		 215 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  61.76 
 
 		 215 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  61.76 
 
 		 215 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  61.76 
 
 		 215 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  61.76 
 
 		 215 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  61.76 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  60.78 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 214 aa  224  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 214 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.16 
 
 		 214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.43 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.88 
 
 		 214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  50.47 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  55.07 
 
 		 208 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  45.1 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.02 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  42.72 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  43.27 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  43.27 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  41.58 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  39.72 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  40.76 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00996  response regulator  43.19 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06170  response regulator  43.19 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.75 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  34.88 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3526  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 254 aa  147  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3299  LuxR response regulator receiver  38.39 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0158345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  39.23 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.2 
 
 		 218 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5199  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>