More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1000 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 161 aa  317  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  72.33 
 
 		 165 aa  227  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  70.44 
 
 		 160 aa  225  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  67.3 
 
 		 163 aa  216  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  69.28 
 
 		 171 aa  213  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  72.26 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  72.26 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  67.3 
 
 		 161 aa  203  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 163 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 185 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  50.64 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  38.56 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  38.56 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  38.67 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  31.01 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.52 
 
 		 152 aa  97.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40.52 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  39.22 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  39.22 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  39.22 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 180 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 178 aa  91.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 200 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 200 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 192 aa  91.3  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 154 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 192 aa  87.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  87  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>