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for query gene VSAL_II0145 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 400 aa  788    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  72.61 
 
 		 401 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  71.07 
 
 		 414 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  72.57 
 
 		 401 aa  548  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  46.37 
 
 		 408 aa  346  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  49.3 
 
 		 408 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  45.31 
 
 		 414 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  45.31 
 
 		 414 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  46.13 
 
 		 422 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  44.94 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  45.97 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  44.24 
 
 		 410 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  44.1 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  44.24 
 
 		 410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  43.98 
 
 		 410 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  46.59 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  44.83 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  44.54 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.22 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  42.66 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  44.22 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  44.22 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  44.25 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  42.77 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  42.77 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679822 
 
 
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NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  42.77 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  42.77 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  42.77 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  42.77 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.336287 
 
 
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NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  42.77 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  44.22 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.49 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  32.2 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  31.16 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.88 
 
 		 407 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.72 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  30.69 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
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NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  30.13 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  32.26 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.78 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
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NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.43 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00358  permease  32.85 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  26.94 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.64 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.67 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.72 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  32.27 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.1 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  30.46 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  28.1 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  28.08 
 
 		 401 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.12 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.34 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.76 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.03 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  27 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.59 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  30.47 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.27 
 
 		 417 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.81 
 
 		 405 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.42 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  37.19 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.42 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.42 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  29.73 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.42 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.42 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.7 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.63 
 
 		 418 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.09 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.82 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  30.45 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.38 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.11 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.68 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  31.46 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  28.46 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  28.86 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.71 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.14 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.14 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2307  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.21 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  28.91 
 
 		 420 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.38 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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