More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02672 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  51.05 
 
 		 200 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  49.47 
 
 		 200 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  48.97 
 
 		 202 aa  207  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  48.95 
 
 		 200 aa  207  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.47 
 
 		 200 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  48.95 
 
 		 200 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 200 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 209 aa  204  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  49.72 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  49.72 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.72 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  49.72 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1997  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  46.45 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333764  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  44.56 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  44.44 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  44.44 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0901  two component response regulator  45.66 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  42.93 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1065  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  43.46 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2088  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  42.35 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1438  LuxR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  42.62 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  40.31 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.84 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  37.89 
 
 		 205 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  41.36 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  40.1 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.21 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  40.72 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  41.24 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  40.1 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 209 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.57 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  39.15 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  39.49 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  42.41 
 
 		 208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  39.15 
 
 		 205 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  37.06 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 247 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.65 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 212 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  36.46 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.58 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1969  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0986563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>