148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0899 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002434  deacetylase DA1  78.69 
 
 		 427 aa  727    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0899  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  902    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03626  hypothetical protein  78.92 
 
 		 427 aa  728    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0564  polysaccharide deacetylase  64.55 
 
 		 424 aa  594  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1411  polysaccharide deacetylase  46.56 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1402  polysaccharide deacetylase  46.56 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1438  polysaccharide deacetylase  46.56 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2943  polysaccharide deacetylase  46.3 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  39.77 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  37.5 
 
 		 305 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  36.59 
 
 		 324 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  34.88 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  42.25 
 
 		 215 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  36.59 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  37.5 
 
 		 305 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  31.87 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 242 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.07 
 
 		 275 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 275 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 275 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 275 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 275 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 275 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 275 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 275 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  41.1 
 
 		 234 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  41.1 
 
 		 234 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00270  deacetylase, putative  37.21 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  40.85 
 
 		 221 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.66 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0405  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.34 
 
 		 271 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  36.76 
 
 		 320 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  36.59 
 
 		 260 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  39.73 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  38.36 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  38.36 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 1120 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 264 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 273 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 235 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  39.71 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  39.73 
 
 		 234 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  39.71 
 
 		 332 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  39.71 
 
 		 332 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 275 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 280 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  39.19 
 
 		 353 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  34.78 
 
 		 280 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 542 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 283 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  37.84 
 
 		 240 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  38.36 
 
 		 234 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  39.13 
 
 		 279 aa  47  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  38.89 
 
 		 267 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  36.23 
 
 		 162 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1903  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 245 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 294 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  38.36 
 
 		 234 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  38.36 
 
 		 234 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  38.36 
 
 		 234 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 372 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.88 
 
 		 352 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 243 aa  46.6  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  32.93 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.56 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  39.44 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6317  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 		 198 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1762  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 		 198 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.17 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.17 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.17 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 260 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 260 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 871 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.54 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.17 
 
 		 260 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>