More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2261 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  50.99 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  50.99 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  51.49 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  49.5 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  51.96 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 208 aa  174  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  47.03 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  47.87 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  48.26 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  47.03 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04497  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  45.5 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  45.5 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  45.18 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  46.77 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  48.53 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  48.53 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  46.57 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  46.6 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  47 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  43.63 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0343  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0236416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0456  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.189833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  45.77 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  47 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  46.94 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  45.77 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  45.77 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  46 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  47.54 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1391  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.88 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  44.78 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3976  30S ribosomal protein S4  45.5 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0779  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  54.43 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>