More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1683 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  100 
 
 		 412 aa  830    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  51.67 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  51.67 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  51.67 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  49.29 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  49.53 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  48.2 
 
 		 404 aa  359  5e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  47.97 
 
 		 408 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  47.14 
 
 		 402 aa  324  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  41.11 
 
 		 403 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  42.79 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  42.55 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  38.67 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  37.79 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  38.33 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  33.19 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  33.63 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  32.32 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  33.05 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  31.85 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  32.09 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  33.33 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  33.19 
 
 		 434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  35.64 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  33.26 
 
 		 413 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  32.96 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.14 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  31.71 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  32.51 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  31.37 
 
 		 442 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  30.22 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  34.99 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  31.66 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  29.61 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  30.75 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.09 
 
 		 438 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  31.29 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  29.97 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.76 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  27.62 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  27.39 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.61 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1818  peptidase M50  26.96 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  27.02 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  41.22 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.11 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  27.55 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.33 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.08 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  31.48 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  31.2 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  28.09 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.79 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  26.65 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  28.73 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  28.73 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  25.12 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  26.27 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  26.78 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  29.65 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  26.15 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  29.03 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  27.8 
 
 		 354 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.7 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  29.27 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  28.09 
 
 		 355 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.74 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.51 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.95 
 
 		 368 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  27.2 
 
 		 352 aa  99.8  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  28.05 
 
 		 354 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  27.25 
 
 		 430 aa  99.4  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.03 
 
 		 455 aa  97.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.35 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.35 
 
 		 355 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.75 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  26.52 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.97 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  28.08 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.51 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  27.7 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  25.55 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  26.67 
 
 		 370 aa  93.6  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1258  membrane-associated zinc metalloprotease  26.97 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.518188 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.28 
 
 		 368 aa  93.2  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  26.62 
 
 		 439 aa  93.2  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.51 
 
 		 355 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.11 
 
 		 343 aa  92.8  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  27.3 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  36.26 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  27.86 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  25.69 
 
 		 451 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  29.46 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  29.46 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  25.95 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.05 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  26.18 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  27.07 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.11 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.4 
 
 		 454 aa  90.1  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>