More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1258 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1258  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
452 aa  901    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.518188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  67.04 
 
 
448 aa  609  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0358  hypothetical protein  62.95 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0323  membrane-associated zinc metalloprotease  62.72 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.728311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.14 
 
 
451 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  44.1 
 
 
454 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  43.21 
 
 
450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.07 
 
 
450 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  44.2 
 
 
450 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.67 
 
 
455 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  40.92 
 
 
456 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  40.92 
 
 
456 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.38 
 
 
456 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  42.99 
 
 
452 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.7 
 
 
456 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.99 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.89 
 
 
456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.52 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.91 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  40.7 
 
 
456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  40.96 
 
 
456 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.52 
 
 
456 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.48 
 
 
456 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  41.28 
 
 
451 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  41.31 
 
 
450 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  43.18 
 
 
454 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.66 
 
 
456 aa  298  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  40.72 
 
 
450 aa  295  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.3 
 
 
456 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.91 
 
 
450 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  40.71 
 
 
451 aa  294  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.77 
 
 
450 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.48 
 
 
455 aa  292  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  41.36 
 
 
450 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.76 
 
 
455 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  38.38 
 
 
461 aa  289  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.55 
 
 
455 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.46 
 
 
454 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  42.95 
 
 
453 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.22 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  41.11 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  40.67 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  40.13 
 
 
456 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.03 
 
 
448 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  40.13 
 
 
451 aa  280  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.34 
 
 
450 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  40.13 
 
 
451 aa  280  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.63 
 
 
461 aa  279  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  40.13 
 
 
451 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.39 
 
 
462 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  39.2 
 
 
450 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  39.39 
 
 
462 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  39.2 
 
 
450 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  39.2 
 
 
450 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  39.2 
 
 
450 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  42.04 
 
 
454 aa  277  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  38 
 
 
466 aa  276  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  38.11 
 
 
452 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  39.2 
 
 
450 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  39.02 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.7 
 
 
450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  38.81 
 
 
450 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  38.81 
 
 
450 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  38.81 
 
 
450 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  38.81 
 
 
450 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  38.81 
 
 
450 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  38.81 
 
 
450 aa  273  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  38.59 
 
 
450 aa  272  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  35.84 
 
 
452 aa  272  9e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  38.59 
 
 
450 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  39.02 
 
 
450 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  37.58 
 
 
452 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  40.13 
 
 
456 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  40.22 
 
 
451 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.38 
 
 
449 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  35.74 
 
 
452 aa  266  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.89 
 
 
450 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.31 
 
 
457 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  40.22 
 
 
462 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  35.43 
 
 
452 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  37.53 
 
 
457 aa  263  6.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  36.7 
 
 
469 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  38.95 
 
 
457 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.95 
 
 
457 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.95 
 
 
457 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  38.48 
 
 
461 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  38.48 
 
 
461 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  35.96 
 
 
443 aa  257  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.43 
 
 
463 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.9 
 
 
458 aa  256  8e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.39 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.71 
 
 
417 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  37.66 
 
 
463 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.73 
 
 
454 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.78 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.83 
 
 
479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.78 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.78 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>