More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0646 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  56.76 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.41 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  53.56 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  55.32 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  53.19 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  54.11 
 
 		 263 aa  246  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.63 
 
 		 280 aa  245  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  58.72 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  51.88 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.68 
 
 		 245 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 264 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  52.87 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  48.69 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  51.49 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  55.41 
 
 		 250 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  55.76 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  55.23 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  52.36 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  51.06 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  51.25 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  51.28 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  50.42 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  53.95 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  48.95 
 
 		 255 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  55.19 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  54.88 
 
 		 259 aa  231  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  53.3 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 279 aa  228  7e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  51.08 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.42 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  54.36 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  52.54 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  51.85 
 
 		 258 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.64 
 
 		 228 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 312 aa  221  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  53.05 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  48.32 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  50 
 
 		 445 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  48.65 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  48.26 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  51.4 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.77 
 
 		 225 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  50.62 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  53 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  52 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  51.87 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  51.82 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.05 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  41.52 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  47.19 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.86 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  50.89 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.64 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  42.67 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  48.07 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  42.42 
 
 		 251 aa  205  8e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.88 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.95 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2204  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  49.19 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  44.58 
 
 		 565 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  43.81 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 237 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.66 
 
 		 253 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  41.63 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.26 
 
 		 241 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  38.56 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.66 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.26 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  44.55 
 
 		 224 aa  198  7e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  45.21 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 253 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.6 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  46.43 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 		 252 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 252 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  44.8 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>