More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0359 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  54.85 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  44.98 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  40.1 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  38.42 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.56 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.36 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  36.14 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.64 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.62 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.64 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.82 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.23 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.36 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.14 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.82 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.96 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.96 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.96 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  36.82 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.97 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.76 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.96 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.65 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.97 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  33.49 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  33.49 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.65 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.49 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.49 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.01 
 
 		 197 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.49 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.49 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.01 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.66 
 
 		 202 aa  89  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  30.05 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.81 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  31.31 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  30.77 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  30.22 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3820  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  34.15 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  50.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  50.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>