More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1816 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  80.53 
 
 
265 aa  442  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  73.11 
 
 
266 aa  400  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  73.86 
 
 
264 aa  394  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  49.58 
 
 
260 aa  219  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  41.38 
 
 
265 aa  184  9e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 
263 aa  171  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 
263 aa  169  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  35.61 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
260 aa  162  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 
279 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
261 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
263 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
260 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  37.36 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  39.04 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  38.87 
 
 
265 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  38.96 
 
 
258 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 
259 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 
287 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
264 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  39.46 
 
 
257 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
264 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  36.64 
 
 
264 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
259 aa  142  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 
250 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  37.34 
 
 
242 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  36.73 
 
 
264 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  39.68 
 
 
293 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
258 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 
252 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 
259 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
258 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  32.97 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  36.33 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  40.08 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  38.78 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  37.59 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  34.22 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  35.95 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  34.22 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  35.89 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  35.34 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
258 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
252 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  36.25 
 
 
258 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.08 
 
 
250 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
255 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  35.89 
 
 
255 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  35.27 
 
 
265 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  35.89 
 
 
266 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0881  stationary-phase survival protein SurE  35.71 
 
 
249 aa  122  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.704956  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 
262 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 
261 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  34.48 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  35.6 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  36.26 
 
 
250 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
254 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1952  stationary-phase survival protein SurE  39.01 
 
 
246 aa  119  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  35.37 
 
 
253 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  36.18 
 
 
244 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  34.15 
 
 
253 aa  118  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  35.19 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  36.5 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  35 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  33.83 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  34.6 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  36.06 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0936  stationary-phase survival protein SurE  35.32 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.371275  normal  0.06931 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  35.61 
 
 
258 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  37.16 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  33.87 
 
 
258 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  32.74 
 
 
269 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  34.54 
 
 
257 aa  115  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  35.08 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  35.08 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  35.57 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  34.9 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  34.69 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  34.69 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  36.29 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  34.92 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  34.83 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>