More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1192 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  72.62 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  62.84 
 
 		 265 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  56.54 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  51.52 
 
 		 263 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  54.41 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  53.94 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  51.72 
 
 		 263 aa  241  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  48.51 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  47.76 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  47.55 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  49.55 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.4 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  35.85 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.46 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  38.8 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  35.61 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  36.74 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  38.75 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  36.23 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  38.64 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  35.96 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.23 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  36.74 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  35.71 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.82 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  34.6 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  32.84 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  31.03 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  33.71 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  36.74 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  37.94 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  37.94 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  33.58 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  35.82 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  39.06 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  37.36 
 
 		 259 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  33.21 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  37.22 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  36.12 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  36.53 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  35.85 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  38.67 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  39.25 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  36.53 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  32.45 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  36.23 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  36.23 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  37.08 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  35.58 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  33.46 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  35.88 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  36.74 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  33.21 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  31.05 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  31.05 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  34.22 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  32.34 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  35.5 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  34.83 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  34.35 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  33.7 
 
 		 269 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 		 252 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  35.36 
 
 		 265 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>