More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1555 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  99.19 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  72.47 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  65.18 
 
 		 252 aa  342  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  67.61 
 
 		 262 aa  334  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  61.22 
 
 		 247 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  58.7 
 
 		 253 aa  314  9e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  56.45 
 
 		 250 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  49.39 
 
 		 251 aa  242  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  45.71 
 
 		 248 aa  234  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  48.16 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  48.39 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  44.72 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  45.9 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  46.37 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  46.15 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  45.49 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  46.77 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  46.77 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  46.94 
 
 		 245 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  45.71 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  45.71 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  45.12 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  45.12 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  44.76 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  44.72 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  44.76 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  44.08 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  47.35 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  44.08 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  43.43 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  48.61 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  43.67 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  43.67 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  45.49 
 
 		 259 aa  211  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  43.67 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  43.02 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  45.93 
 
 		 249 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  45.78 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  43.27 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  45.71 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  45.38 
 
 		 263 aa  208  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  46.99 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  43.27 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  44.08 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  44.72 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  44.08 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  43.5 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  44.26 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  44.08 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  45.2 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  43.27 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1562  stationary-phase survival protein SurE  46.34 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.511421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  44.66 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  43.27 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  43.98 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  43.27 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  43.67 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  46.94 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>