More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1087 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 253 aa  521  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  68.98 
 
 		 247 aa  362  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  60.73 
 
 		 248 aa  322  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  61.69 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  62.9 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  59.84 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  58.7 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  58.3 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  51.19 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  48.98 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  49.39 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  48.36 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  50.8 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  47.95 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  48.16 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  45.71 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  48.37 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  46.94 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  46.59 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  44.62 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  46.53 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  46.53 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  46.53 
 
 		 249 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  47.76 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  48.98 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  47.56 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  47.56 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  47.56 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  46.96 
 
 		 259 aa  224  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  46.96 
 
 		 249 aa  224  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 		 255 aa  224  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  45.75 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  45.75 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  46.96 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  46.53 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  49.2 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 		 249 aa  218  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  47.2 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  44.76 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  45.78 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  48.18 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  45.2 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  45.2 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  44.67 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  47.39 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  46.18 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  46.8 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  46.18 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  46.94 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  45.71 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  46.18 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  46.53 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  43.67 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  46.94 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  46.4 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  43.67 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  44.98 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  44.98 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  45.93 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  46.99 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  43.67 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  45.16 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  44.98 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  44.08 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  46.53 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  44.44 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 265 aa  211  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  45.93 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>