More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2737 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  68.98 
 
 
253 aa  362  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  63.67 
 
 
248 aa  340  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  66.53 
 
 
262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  63.97 
 
 
252 aa  332  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  61.22 
 
 
248 aa  305  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  60.98 
 
 
250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  60.82 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  52.85 
 
 
251 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  53.39 
 
 
252 aa  245  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  52.97 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  49.19 
 
 
248 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  49.19 
 
 
259 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  48.18 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  49.59 
 
 
257 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  47.56 
 
 
248 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  48.18 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  48.18 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  47.6 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  47.6 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  50.2 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  48.58 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  47.97 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  46.37 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  48.99 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  48.37 
 
 
245 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  48.39 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 
246 aa  232  5e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  50.41 
 
 
251 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  48.58 
 
 
257 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  47.15 
 
 
249 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  48.58 
 
 
253 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  48.58 
 
 
253 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  48.58 
 
 
253 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  48.58 
 
 
253 aa  229  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 
258 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  48.99 
 
 
254 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  48.58 
 
 
253 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  48.99 
 
 
254 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  47.15 
 
 
249 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  48.58 
 
 
253 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  48.58 
 
 
255 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  48.58 
 
 
253 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  48.58 
 
 
253 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 
248 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  45.56 
 
 
247 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 
258 aa  228  6e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  48.99 
 
 
254 aa  228  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 
249 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 
249 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 
249 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 
249 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 
249 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 
251 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  50.81 
 
 
254 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  46.22 
 
 
260 aa  225  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  47.37 
 
 
257 aa  225  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 
247 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  46.94 
 
 
250 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  44.72 
 
 
249 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 
249 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  46.56 
 
 
254 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
249 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  48.18 
 
 
255 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  47.77 
 
 
255 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  47.77 
 
 
253 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  47.77 
 
 
253 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  47.72 
 
 
252 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  48.18 
 
 
253 aa  221  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  43.5 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  47.15 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  44.31 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  48.81 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  47.15 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  47.15 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 
252 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  45.93 
 
 
253 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  48.35 
 
 
289 aa  218  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  46.99 
 
 
251 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  47.37 
 
 
255 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  47.56 
 
 
253 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  48.97 
 
 
265 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  46.59 
 
 
251 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  48.24 
 
 
255 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 
253 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  44.9 
 
 
252 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 
252 aa  214  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 
250 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>