More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1150 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  100 
 
 
264 aa  543  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
255 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  48.65 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  50 
 
 
259 aa  238  9e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  47.73 
 
 
260 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  49.81 
 
 
258 aa  234  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  48.81 
 
 
251 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  49.62 
 
 
253 aa  224  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  43.42 
 
 
281 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  43.42 
 
 
281 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  46.8 
 
 
270 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  44.8 
 
 
268 aa  218  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  49.59 
 
 
255 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  43.82 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 
252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  45.2 
 
 
265 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 
250 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  44.8 
 
 
247 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 
259 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  44 
 
 
247 aa  205  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  42.21 
 
 
251 aa  204  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  41.89 
 
 
265 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  45.63 
 
 
257 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.5 
 
 
247 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 
252 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  45.16 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  40.49 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  43.55 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  45.16 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 
269 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  42.75 
 
 
293 aa  198  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  40.41 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  42.06 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 
248 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  42.56 
 
 
258 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  43.8 
 
 
258 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
269 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
249 aa  195  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 
250 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 
255 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  38.11 
 
 
260 aa  193  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
269 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  43.57 
 
 
246 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  41.39 
 
 
259 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  43.15 
 
 
257 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  44.81 
 
 
253 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 
251 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  42.56 
 
 
249 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  41.98 
 
 
247 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 
255 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  44.03 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  39.85 
 
 
252 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  41.44 
 
 
270 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  44.12 
 
 
255 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  43.75 
 
 
253 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  41.32 
 
 
287 aa  188  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  43.7 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  43.7 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  39.77 
 
 
252 aa  188  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  43.7 
 
 
255 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 
249 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 
249 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  43.7 
 
 
255 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  42.04 
 
 
251 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  39.69 
 
 
255 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  42.74 
 
 
245 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  42.04 
 
 
257 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 
249 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 
249 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  44.17 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  44.17 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  44.17 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  44.17 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
272 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  44.17 
 
 
255 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  44.17 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  44.17 
 
 
253 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  44.17 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  44.17 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  43.39 
 
 
248 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
258 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  40.34 
 
 
246 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  39.92 
 
 
250 aa  185  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 
250 aa  185  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.98 
 
 
248 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
262 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
262 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  40.41 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>