More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1523 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  76.21 
 
 		 252 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  73.79 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  66.53 
 
 		 247 aa  346  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  62.9 
 
 		 253 aa  325  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  67.61 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  67.61 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  63.05 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 252 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  50.57 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  47.56 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  48.59 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  50.99 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  47.76 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  48.98 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  49.8 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  46.18 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  51.42 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  49.19 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  47.76 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  48.4 
 
 		 252 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 249 aa  225  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  48.57 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  48.4 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  48.37 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  48.37 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  44.35 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  49.59 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  48.16 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  47.79 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  46.77 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  47.79 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  48.39 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  46.96 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  48.4 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  48.37 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  48.37 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  48.4 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  48.98 
 
 		 247 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  49.39 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  45.71 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  48.37 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  44.08 
 
 		 247 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  49.03 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  46.12 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  49.62 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  47.72 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  47.97 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  45.6 
 
 		 255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  47.97 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  48.37 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 		 246 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  48.57 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  45.9 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  46.07 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  49.23 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  46.77 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  42.42 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  46.43 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  43.45 
 
 		 265 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  43.18 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  44.84 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  45.67 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 		 272 aa  205  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>