More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2116 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
265 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  82.82 
 
 
265 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  67.95 
 
 
271 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  66.41 
 
 
281 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  66.41 
 
 
281 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  66.79 
 
 
270 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  66.54 
 
 
268 aa  353  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  64.86 
 
 
258 aa  342  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  51.36 
 
 
269 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  52.31 
 
 
262 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  52.31 
 
 
262 aa  264  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  53.1 
 
 
269 aa  264  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  51.36 
 
 
269 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  50.97 
 
 
269 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  50.97 
 
 
269 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  53.1 
 
 
269 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  49.03 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  49.81 
 
 
269 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  46.24 
 
 
259 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  49.43 
 
 
253 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  46.62 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  47.91 
 
 
255 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  47.69 
 
 
260 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  47.53 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  45.42 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  45.21 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  48.33 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  44.32 
 
 
252 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  44.23 
 
 
248 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  46 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  44.84 
 
 
255 aa  215  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 
259 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  43.13 
 
 
250 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  44.06 
 
 
258 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  44.03 
 
 
250 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  43.68 
 
 
252 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  42.41 
 
 
255 aa  209  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  42.31 
 
 
251 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  42.64 
 
 
262 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  45.04 
 
 
263 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  43.41 
 
 
259 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  42.64 
 
 
262 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 
248 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  43.73 
 
 
247 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  38.7 
 
 
260 aa  204  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  44.11 
 
 
248 aa  204  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  44.66 
 
 
258 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  42.41 
 
 
251 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 
257 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  45.86 
 
 
262 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 
252 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  43.19 
 
 
247 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 
259 aa  202  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 
247 aa  201  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 
252 aa  201  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 
247 aa  201  9e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  40.46 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  43.3 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  41.7 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  43.08 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 
257 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
248 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  40.84 
 
 
255 aa  192  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 
259 aa  192  6e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
249 aa  191  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 
249 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  42.47 
 
 
250 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  43.3 
 
 
293 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  39.31 
 
 
287 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 
249 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  41.38 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 
250 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
249 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
249 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
249 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  39.46 
 
 
259 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 
258 aa  189  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  39.23 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  39.23 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  41.15 
 
 
254 aa  188  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  42.31 
 
 
251 aa  188  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  41.06 
 
 
252 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
258 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  43.02 
 
 
255 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 
249 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 
250 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 
246 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
249 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 
272 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  39.31 
 
 
258 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  42.31 
 
 
249 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  39.63 
 
 
263 aa  183  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>