More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1140 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  99.2 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  94.42 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  78.23 
 
 		 250 aa  407  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  77.02 
 
 		 250 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  73.39 
 
 		 253 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  72.58 
 
 		 253 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  72.98 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  71.77 
 
 		 253 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  71.77 
 
 		 253 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  71.77 
 
 		 253 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  71.37 
 
 		 253 aa  359  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  71.37 
 
 		 252 aa  358  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  70.97 
 
 		 253 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  70.97 
 
 		 253 aa  357  7e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  70.97 
 
 		 253 aa  357  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  70.97 
 
 		 253 aa  357  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  70.97 
 
 		 253 aa  357  7e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  70.56 
 
 		 253 aa  357  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  70.56 
 
 		 253 aa  357  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  70.97 
 
 		 253 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  70.56 
 
 		 252 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  69.76 
 
 		 252 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  64.26 
 
 		 261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  66.67 
 
 		 257 aa  337  8e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  64.54 
 
 		 253 aa  315  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  57.66 
 
 		 255 aa  298  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  60.24 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  60.89 
 
 		 247 aa  294  9e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  56.18 
 
 		 261 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  57.37 
 
 		 261 aa  291  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  53.63 
 
 		 247 aa  291  9e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  61.16 
 
 		 263 aa  288  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  60.25 
 
 		 289 aa  288  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  57.38 
 
 		 253 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  57.79 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  59.68 
 
 		 259 aa  284  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  62.5 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  62.5 
 
 		 260 aa  281  9e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  55.65 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  54.84 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  54.25 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  54.25 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  54.03 
 
 		 251 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  52.82 
 
 		 245 aa  265  7e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  55.2 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  53.01 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0835  stationary phase survival protein SurE  58.17 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.153163  normal  0.263072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  55.24 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  49.8 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  52.21 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 248 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  49.19 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 249 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 249 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  51.21 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  51.9 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  47.6 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  51.48 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  51.41 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 249 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 249 aa  248  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  49.8 
 
 		 251 aa  248  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  49.8 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  49.19 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  47.98 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  47.98 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  47.98 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  49.19 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  47.98 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  50.81 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  47.98 
 
 		 249 aa  242  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  46.37 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  49.19 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  50.81 
 
 		 249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  48.61 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  47.81 
 
 		 259 aa  234  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 249 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  51.63 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1129  stationary phase survival protein SurE  51.21 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  44.76 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  47.18 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17450  stationary phase survival protein SurE  50.4 
 
 		 249 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1514  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 249 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  47.2 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  46.37 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  46.37 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  46.37 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  46.37 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  46.59 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>