More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3860 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 248 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  60.48 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  58.06 
 
 		 260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  57.49 
 
 		 245 aa  308  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  58.37 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  56.45 
 
 		 249 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  54.03 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  57.26 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  56.05 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  53.23 
 
 		 249 aa  298  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  54.03 
 
 		 248 aa  298  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  54.03 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  54.03 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  52.82 
 
 		 250 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  54.03 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  54.03 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  54.03 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  53.23 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  52.42 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  53.63 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  53.63 
 
 		 249 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  55.65 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  56.05 
 
 		 258 aa  292  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  53.88 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  53.85 
 
 		 250 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  53.85 
 
 		 250 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  54.84 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  52.42 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  53.41 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  53.23 
 
 		 252 aa  284  8e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  53.23 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  54.47 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  53.88 
 
 		 251 aa  281  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  51.21 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  52.65 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  53.23 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  53.88 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  53.88 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  54.29 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  53.04 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  50.81 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  54.44 
 
 		 253 aa  275  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  54.69 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  51.57 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  51.57 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  52.65 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  52.23 
 
 		 246 aa  272  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  52.24 
 
 		 253 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  53.47 
 
 		 253 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  53.47 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  53.47 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  53.06 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  53.47 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  53.47 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  53.06 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  51.43 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  52.65 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  52.65 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  53.82 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  53.82 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  53.82 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  53.82 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  53.82 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  53.82 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  53.82 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  53.82 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  53.82 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  52.85 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  52.85 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  53.41 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  53.01 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  53.01 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  53.01 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  52.02 
 
 		 254 aa  263  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  53.63 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  51.42 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  53.01 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  50.82 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  50.82 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  49.8 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  49.8 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  51.02 
 
 		 246 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  50.4 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  50.2 
 
 		 249 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  49.39 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  50.2 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  50.2 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  54.69 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0835  stationary phase survival protein SurE  54.29 
 
 		 247 aa  254  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.153163  normal  0.263072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  49.4 
 
 		 250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  47.6 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  47.18 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  47.18 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1129  stationary phase survival protein SurE  50.2 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  47.2 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17450  stationary phase survival protein SurE  48.57 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  47.6 
 
 		 251 aa  248  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>