More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2509 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 254 aa  524  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  71.95 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  71.14 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  71.02 
 
 		 263 aa  359  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  59.02 
 
 		 245 aa  299  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  59.35 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  57.49 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  57.32 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  56.73 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  56.5 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  57.32 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  57.32 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  57.32 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  56.5 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  55.06 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  56.85 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 249 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  56.68 
 
 		 255 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  55.24 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  55.69 
 
 		 249 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  55.69 
 
 		 249 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  54.47 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  53.04 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  54.88 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  52.63 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  54.12 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  56.1 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  57.72 
 
 		 251 aa  275  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  56.1 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  55.16 
 
 		 251 aa  274  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  56.33 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  56.33 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  54.47 
 
 		 254 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  55.92 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  54.47 
 
 		 254 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  56.33 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  56.33 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  56.33 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  52.23 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  53.44 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  54.07 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  53.01 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  55.1 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  54.88 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  55.06 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  52.46 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  56.36 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  56.36 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  55.69 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  52.85 
 
 		 253 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  53.25 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  53.25 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  53.88 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  55.28 
 
 		 253 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  55.28 
 
 		 253 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  55.28 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  54.88 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  53.01 
 
 		 259 aa  261  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  54.88 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  52.19 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  54.88 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  52.19 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  54.88 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  50.6 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  54.47 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  54.47 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  54.47 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  54.07 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  54.47 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  54.07 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  54.47 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  50.6 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  53.63 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  49.8 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  53.66 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  52.44 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  49 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  50.4 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0835  stationary phase survival protein SurE  56.5 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.153163  normal  0.263072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  48.21 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  49.8 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  49.41 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  49.38 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  51.01 
 
 		 250 aa  235  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  47.43 
 
 		 261 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  49.39 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  50.99 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  46.56 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>