More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1245 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  40.94 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 		 247 aa  204  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  42.98 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  42.98 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  42.98 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  42.55 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  42.55 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  41.7 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  42.98 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  42.98 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  42.98 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  42.37 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  41.06 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  41.28 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  40.85 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  42.39 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  41.39 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  40.85 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  41.06 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  41.34 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  42.25 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  42.68 
 
 		 259 aa  195  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  42.04 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  42.98 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  40 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  42.04 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  45.49 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  45.49 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  40.66 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  41.57 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  42.55 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  41.35 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  40.74 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  42.21 
 
 		 259 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  42.62 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  41.35 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  39.92 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  39.18 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  40.34 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  40.75 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  39.92 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  38.95 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  38.95 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  42.45 
 
 		 246 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  40.83 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>