More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2063 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  65.62 
 
 
270 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  63.22 
 
 
271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  62.93 
 
 
281 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  62.93 
 
 
281 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  65.12 
 
 
265 aa  338  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  64.02 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  59.92 
 
 
268 aa  321  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  52.55 
 
 
269 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  55.98 
 
 
269 aa  277  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  51.76 
 
 
269 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  55.6 
 
 
269 aa  276  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  51.55 
 
 
262 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  50.77 
 
 
269 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  50.77 
 
 
269 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  50.38 
 
 
269 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  51.16 
 
 
262 aa  268  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  54.51 
 
 
269 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  44.23 
 
 
259 aa  241  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  50.59 
 
 
255 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  47.88 
 
 
255 aa  235  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  49.81 
 
 
264 aa  234  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  45.08 
 
 
258 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  47.66 
 
 
253 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  46.06 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  49.61 
 
 
257 aa  219  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  48.44 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 
255 aa  217  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  43.92 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  42.35 
 
 
252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  44.96 
 
 
253 aa  207  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  42.52 
 
 
247 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 
259 aa  206  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  43.72 
 
 
250 aa  205  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  43.43 
 
 
255 aa  205  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
247 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  43.46 
 
 
250 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 
259 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  45.06 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  45.31 
 
 
259 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 
258 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  43.31 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 
250 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  43.92 
 
 
248 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  46.3 
 
 
263 aa  198  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  41.11 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  44.71 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  44.88 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  43.97 
 
 
293 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  44.14 
 
 
248 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 
252 aa  195  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 
259 aa  195  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 
252 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  45.31 
 
 
258 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  42.64 
 
 
262 aa  194  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  46.36 
 
 
262 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  44.53 
 
 
245 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  45.14 
 
 
258 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 
262 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 
262 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 
251 aa  192  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  44.31 
 
 
257 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  43.72 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  42.58 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  38.58 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  40.23 
 
 
259 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 
273 aa  188  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 
259 aa  188  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  40.62 
 
 
246 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  41.7 
 
 
257 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
249 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  43.19 
 
 
258 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  43.7 
 
 
251 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
255 aa  185  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  41.96 
 
 
254 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 
258 aa  184  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  41.57 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  42.58 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  43.92 
 
 
251 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  44.14 
 
 
254 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  40.39 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  40.39 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  43.97 
 
 
249 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  44.36 
 
 
249 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  41.41 
 
 
249 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  43.97 
 
 
249 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 
258 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  40.62 
 
 
250 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 
254 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
259 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  43.75 
 
 
249 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  41.34 
 
 
249 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>