More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2041 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 263 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  77.47 
 
 		 257 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  72.14 
 
 		 265 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  72.83 
 
 		 258 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  71.26 
 
 		 258 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  68.32 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  70.47 
 
 		 259 aa  388  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  47.29 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  43.18 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  42.25 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  43.65 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  41.34 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  44.77 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  39.22 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 262 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  38.52 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  38.28 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  39.2 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 257 aa  185  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.8 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 251 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  35.77 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 247 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.85 
 
 		 265 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  36.61 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  37.89 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  36.54 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  42.52 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  41.71 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  35.14 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>