More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2386 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 265 aa  551  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  85.83 
 
 		 258 aa  471  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  81.4 
 
 		 258 aa  457  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  82.28 
 
 		 259 aa  447  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  77.1 
 
 		 272 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  74.22 
 
 		 257 aa  415  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  72.14 
 
 		 263 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  49.03 
 
 		 293 aa  250  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  44.31 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  43.53 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  44.09 
 
 		 287 aa  214  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  42.35 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 247 aa  198  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  42.5 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 250 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  39.04 
 
 		 250 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  40.65 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 271 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 		 263 aa  185  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  38.06 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  38.21 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  39.23 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  40.65 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.72 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  38.8 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  36.84 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  37.1 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  42.06 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  36.69 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 251 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  38.65 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  35.48 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  35.48 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  38.17 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  36.84 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  36.84 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  36.84 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  39.23 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  35.77 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  35.77 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  35.77 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  36.44 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  38.27 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>