More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0932 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 259 aa  538  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  70 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  67.84 
 
 		 258 aa  357  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  62.26 
 
 		 256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  62.75 
 
 		 287 aa  334  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  62.35 
 
 		 259 aa  324  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  60.55 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  57.54 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  51.36 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  44.09 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  44.14 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  44.31 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  41.57 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  42.06 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  40.94 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  40.98 
 
 		 281 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  40.98 
 
 		 281 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  42.64 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  44.35 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  41.57 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  40.3 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 258 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 265 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  41.46 
 
 		 247 aa  175  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  37.2 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  40.49 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  47.62 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 248 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  43.85 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  38.65 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  37.7 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 249 aa  164  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  36.65 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  40.34 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  37.83 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  40.67 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  36.5 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  35.86 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  37.1 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  36.84 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  36.15 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  34.77 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  34.77 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  38.7 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>