More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1187 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 270 aa  556  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  41.44 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  39.53 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  40.84 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  40.07 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.31 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  41.47 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 245 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40.71 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 		 260 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  37.83 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  40.54 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  37.79 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  40.16 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  40.46 
 
 		 251 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.85 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  37.22 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 252 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  38.78 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  40.96 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  40.62 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  35.41 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  40.15 
 
 		 250 aa  165  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  36.53 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  36.53 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  39.7 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  39.75 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  38.7 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  39.62 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  36.5 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  36.44 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  39.15 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  38.76 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  38.76 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  38.76 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  37.97 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  37.32 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  36.22 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  39.36 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  39.36 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  35.97 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 		 253 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  39.1 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  39.78 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>