More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1169 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  50.81 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  48.4 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  43.19 
 
 		 259 aa  225  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  43.55 
 
 		 272 aa  224  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  46.59 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  47.41 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  45.1 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  46.37 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  44.08 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  48.39 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  44.62 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  46.61 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  46.37 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  45.02 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  43.53 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  47.04 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  42.34 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  42.39 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  43.82 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  39.85 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  43.46 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  39.85 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  40.84 
 
 		 265 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  44.98 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  43.55 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  44.66 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  44.35 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  42.68 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  43.37 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  43.27 
 
 		 247 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  46.61 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  37.84 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  40.96 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  40.96 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  41.83 
 
 		 287 aa  188  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  40 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  44.35 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  43.55 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  42.45 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 249 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  43.82 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  40.98 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>