More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1231 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  62 
 
 
255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  53.78 
 
 
253 aa  274  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  49.22 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  51.38 
 
 
260 aa  241  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  47.31 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  46.79 
 
 
268 aa  239  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  50.99 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  46.74 
 
 
281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  46.74 
 
 
281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  49.61 
 
 
258 aa  231  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  47.58 
 
 
265 aa  228  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  47.35 
 
 
265 aa  225  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  48.09 
 
 
270 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  46.39 
 
 
271 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  48.41 
 
 
251 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  47.62 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  48.44 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  45.28 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  44.62 
 
 
252 aa  211  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  44.75 
 
 
250 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  48.61 
 
 
257 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  44.66 
 
 
250 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  46.06 
 
 
248 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  46.69 
 
 
265 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  45.67 
 
 
251 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  47.24 
 
 
255 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  46.46 
 
 
257 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  46.06 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  44.84 
 
 
269 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  46.85 
 
 
253 aa  198  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  45.28 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 
253 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  41.31 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 
251 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  45.2 
 
 
261 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  44 
 
 
247 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  43.31 
 
 
245 aa  192  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  44.31 
 
 
263 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 
262 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  46.46 
 
 
249 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  42.35 
 
 
263 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  42.46 
 
 
250 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 
254 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 
272 aa  192  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  43.92 
 
 
258 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  46.06 
 
 
249 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 
247 aa  191  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  43.92 
 
 
258 aa  191  9e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 
262 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.3 
 
 
262 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  45.67 
 
 
249 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  45.45 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  45.67 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 
255 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 
252 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  45.28 
 
 
255 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  41.34 
 
 
248 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 
252 aa  188  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 
259 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 
254 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  43.02 
 
 
259 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  43.92 
 
 
259 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  43.78 
 
 
269 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  43.31 
 
 
258 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  42.46 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  42.46 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  44.57 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  41.53 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  45.28 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  45.28 
 
 
251 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  43.78 
 
 
269 aa  182  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 
254 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
249 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
249 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 
257 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  43.48 
 
 
253 aa  181  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.13 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
249 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
248 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  42.97 
 
 
251 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 
269 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  42.29 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>