More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0040 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  63.2 
 
 		 265 aa  322  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  64.75 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  48.61 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  48.81 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  49.79 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  51.57 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  46 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  47.62 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  47.26 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  47.04 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  45.27 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  48.77 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  46.09 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  44.09 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  42.86 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  49.58 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  44.26 
 
 		 287 aa  188  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  46.67 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  46.19 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  40.62 
 
 		 252 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  43.97 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  49.79 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  43.97 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.31 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2160  stationary-phase survival protein SurE  46.19 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  40.94 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 245 aa  181  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  43.58 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  43.14 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  43.14 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  41.44 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  43.97 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  44.88 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  46.09 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  41.95 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  39.22 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 249 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  43.21 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  44.13 
 
 		 243 aa  174  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  39.25 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  43.7 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  41.02 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  41.29 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  44.14 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  40.7 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  45.14 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  44.54 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  42.52 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  39.11 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  43.58 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  42.51 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  43.21 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  43.21 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  43.21 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  43.21 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>