More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2978 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  48.81 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  46.06 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 281 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 281 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  45.8 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 271 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  45.45 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  45.38 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  46.77 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  48.41 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  47.88 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  44.53 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  45.16 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  44.35 
 
 		 247 aa  201  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  42.08 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  44.19 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  44.98 
 
 		 253 aa  198  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  42.41 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  45.16 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  44.31 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  42.68 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  44.94 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  42.68 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  41.04 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  44.18 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  45.1 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  39.92 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  44.98 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  43.44 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  42.63 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  44.8 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  42.51 
 
 		 269 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  40.56 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  42.29 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  42.53 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  46.64 
 
 		 246 aa  185  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  40.49 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  45.38 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  41.2 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  42.04 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  44.86 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  47.5 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  43.53 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  47.5 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  42.32 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  43.72 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 		 249 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  45 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  45 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  44.35 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  45 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  45 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  42.19 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 261 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  45.87 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  45 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  43.65 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  42.5 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  42.32 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 252 aa  175  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 		 269 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>