More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0130 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 257 aa  534  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  58.75 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  58.57 
 
 		 259 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  58.66 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  54.94 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  56.2 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  41.7 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  39.54 
 
 		 265 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  36.88 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  37.89 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  39.43 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  35.21 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  39.23 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 269 aa  164  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  34.77 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  39.13 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  35.14 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.06 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  35.66 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 273 aa  158  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  34.77 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  38.11 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 287 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  39.22 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  35.88 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  36.68 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  37.4 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  37.4 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  39.17 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  36.68 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  36.76 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  34.01 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  38.82 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>