More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2701 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 263 aa  530  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  68.9 
 
 		 252 aa  359  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  64.84 
 
 		 254 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  64.57 
 
 		 254 aa  349  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  64.57 
 
 		 254 aa  349  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  66.14 
 
 		 253 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  63.78 
 
 		 254 aa  348  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  65.87 
 
 		 253 aa  345  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  63.75 
 
 		 280 aa  318  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  59.38 
 
 		 255 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  58.98 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  58.91 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  57.81 
 
 		 255 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  58.98 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  60.16 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  53.93 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  58.47 
 
 		 255 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  58.66 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  55.47 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  55.51 
 
 		 257 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  55.12 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  57.48 
 
 		 255 aa  281  8.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  57.09 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  55.12 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  55.12 
 
 		 252 aa  275  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  53.99 
 
 		 269 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  51.35 
 
 		 264 aa  258  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  49.8 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  50.62 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  45.45 
 
 		 259 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  43.87 
 
 		 259 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  46.64 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  48.4 
 
 		 273 aa  228  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  44.27 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  47.43 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  42.35 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  43.19 
 
 		 261 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  43.19 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  43.19 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  43.25 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  42.06 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  45.38 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  45.38 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 253 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40.98 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  43.27 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.28 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.76 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  40.5 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 248 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  40.55 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  40.75 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  40.55 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  42.21 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  40.33 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  41.46 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  36.78 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.34 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  39.25 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>