More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1101 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  73.98 
 
 		 265 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  64.75 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  49.4 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  49.38 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  48.8 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  48.4 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  49.37 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  45.63 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2160  stationary-phase survival protein SurE  48.52 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  46.22 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  45.85 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  50 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  45 
 
 		 287 aa  197  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  46.64 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  43.97 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  47.79 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  43.43 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  47.6 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  45.78 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  48.61 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  47.72 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  47.3 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  46.47 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  44.96 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  46.89 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  46.47 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  46.5 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  46.09 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  43.44 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  41.34 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  44.67 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  44.4 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  46.72 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  45.9 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  45.9 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  46.18 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  45.68 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  40.84 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  45.64 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  42.53 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  42.32 
 
 		 252 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  45.02 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  45.02 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  45.02 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  45.02 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  44.09 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  43.53 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  43.65 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  41.37 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  45.08 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  42.31 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  42.21 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  45.56 
 
 		 254 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  43.25 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  47.3 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  44.03 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  46.85 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  45.08 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  43.53 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  43.57 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  39.84 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  42.29 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 258 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  43.19 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  45.04 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  43.03 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  43.03 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  43.92 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>