More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3500 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 243 aa  497  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2160  stationary-phase survival protein SurE  81.28 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  75.53 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  58.68 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  46.64 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  46.25 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 270 aa  158  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  38.3 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  40.34 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.42 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  37.34 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  37.87 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  36.97 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 259 aa  144  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  37.87 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0797  stationary phase survival protein SurE  37.87 
 
 		 265 aa  142  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000405923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  39.42 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  37.76 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  40.66 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  37.82 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 264 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  36.95 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  40.65 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  35.27 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  37.13 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  36.11 
 
 		 255 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  36.89 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  36.1 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  38.93 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  35.86 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  39.17 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  37.7 
 
 		 265 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 269 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  36.48 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  38.04 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  35.42 
 
 		 252 aa  135  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  39.34 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  36.21 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  35.71 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  40.59 
 
 		 293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  39.34 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  38.24 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  38.24 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  38.24 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  38.24 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  38.24 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  38.24 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  38.24 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  38.24 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  38.24 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  35.2 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  37.92 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  37.92 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  36.82 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  35.32 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  38.78 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  36.07 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  36.03 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  36.63 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>