More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0638 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  61.66 
 
 		 273 aa  310  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  50.79 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  50.79 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  52.42 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  51.63 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  50.59 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  51.22 
 
 		 264 aa  249  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  51.22 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  46.77 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  50.4 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  50.62 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  49.59 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  47.27 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  47.95 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  46.88 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  49.39 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  50.41 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  48.61 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  48.99 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  48.22 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  48.22 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  47.04 
 
 		 255 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  48.36 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  48.99 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  47.27 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  46.3 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  45.49 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  46.36 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  45.08 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  45.53 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 259 aa  204  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  44.72 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  44.72 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  44.72 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  44.31 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  43.9 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  44.14 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  42.52 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  42.35 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  45.34 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  42.34 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  41.87 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  40.94 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  37.19 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  42.63 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  42.31 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  40.66 
 
 		 249 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  44 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.65 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  41.7 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>