More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0752 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
262 aa  541  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  46.36 
 
 
259 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  45.08 
 
 
255 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  44.09 
 
 
252 aa  205  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 
252 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  43.65 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 
252 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  43.43 
 
 
257 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  45.56 
 
 
253 aa  195  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  45.67 
 
 
262 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  42.64 
 
 
258 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  44.57 
 
 
255 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
255 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
255 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
253 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
255 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
253 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
253 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  45.75 
 
 
253 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  45.75 
 
 
253 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
253 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  45.75 
 
 
253 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
253 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
253 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
253 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
253 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
255 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 
250 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
258 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  44.53 
 
 
253 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  43.43 
 
 
251 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  43.85 
 
 
265 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  44.76 
 
 
254 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 
254 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 
254 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 
251 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  41.34 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
259 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 
248 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  41.57 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  41.57 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
249 aa  182  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
258 aa  181  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.84 
 
 
258 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 
251 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 
259 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  41.51 
 
 
270 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 
253 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  44.13 
 
 
248 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  40.31 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  40.38 
 
 
265 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  41.3 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
248 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  37.64 
 
 
271 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  43.36 
 
 
253 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  42.35 
 
 
246 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 
249 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  39.61 
 
 
250 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
249 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  41.57 
 
 
252 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
249 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
249 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
249 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  41.43 
 
 
264 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 
254 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
259 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  39.31 
 
 
252 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  41.9 
 
 
254 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  40.71 
 
 
249 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  43.2 
 
 
257 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
281 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
281 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  38.82 
 
 
249 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
249 aa  175  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  39.22 
 
 
249 aa  175  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
249 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
249 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
249 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  39.03 
 
 
265 aa  174  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  41.02 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  39.68 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.82 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
255 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 
259 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  42.31 
 
 
258 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  41.22 
 
 
247 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 
251 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  40.78 
 
 
250 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  40.78 
 
 
250 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  39.31 
 
 
257 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  39.53 
 
 
254 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>